목조연화대좌는 목조삼존불좌상 및 복장유물, 육각수미단과 함께 보물로 지정되어있다. 현재 석조대좌들은 삼국시대에 제작되어진 것들도 현존하고 있지만, 나무로 만들어진 목조대좌는 조선시대의 유물이 대부분이다. 하지만 고려시대의 목조연화대좌로는 수덕사 대웅전의 연화대좌가 거의 유일하다고 보아도 무방할 것이다.